フラット３５は民間金融機関から住宅金融支援機構が提携した長期固定金利住宅ローンです。
ローン買取のための資金は住宅金融公庫がこの住宅ローンを担保とした債権を発行（証券化）して、信託銀行などから集めています。このため、「証券化ローン」と呼ばれます。
一般的に銀行などの民間金融機関は短期で資金を調達するため、長期固定金利の住宅ローンを提供することが難しいわけですが、住宅金融支援機構との提携によって長期固定金利型の住宅ローンを提供できるようになっています。
あなたが住宅ローンの資金を受け取ると同時に、金融機関はあなたに対する住宅ローン債権（ローンを返してもらう権利）を住宅金融支援機構に譲渡します。
住宅金融支援機構は、それを担保とした債券を投資家に発行することで、住宅ローンを買い取るのための資金を調達します。
あなたのの住宅ローン債権が金融機関から住宅金融公庫に譲渡された後も、融資金利や返済期間などの契約条件に変更はなく、返済手続きなどは申込んだ金融機関が窓口となります。